سياحة و سفر

معظم حالات نيويورك التاجية جاءت من أوروبا ، تظهر الجينوم

[ad_1]

يشير بحث جديد إلى أن الفيروس التاجي بدأ في الانتشار في منطقة نيويورك بحلول منتصف فبراير ، قبل أسابيع من أول حالة مؤكدة ، وأن المسافرين جلبوا الفيروس بشكل رئيسي من أوروبا ، وليس من آسيا.

قال هارم فان باكيل ، عالِم الوراثة بكلية طب إيكان بجبل سيناء ، والذي شارك في كتابة مراجعة بانتظار المراجعة من الأقران: “الغالبية أوروبية بشكل واضح”.

فريق منفصل في جامعة نيويورك. توصلت مدرسة غروسمان للطب إلى استنتاجات مماثلة بشكل لافت للنظر ، على الرغم من دراسة مجموعة مختلفة من الحالات. قام كلا الفريقين بتحليل الجينوم من الفيروسات التاجية المأخوذة من سكان نيويورك بدءًا من منتصف مارس.

وكشف البحث عن انتشار خفي سابق للفيروس ربما تم اكتشافه إذا تم وضع برامج اختبار عدوانية.

في 31 يناير ، منع الرئيس ترامب الأجانب من دخول البلاد إذا كانوا في الصين خلال الأسبوعين السابقين.

لن تبدأ إيطاليا حتى أواخر فبراير في إغلاق البلدات والمدن ، وفي 11 مارس عندما قال ترامب إنه سيحظر المسافرين من معظم الدول الأوروبية. لكن .

قالت أدريانا هيغوي ، عضو في جامعة نيويورك: “كان الناس غافلين تمامًا”. الفريق.

ينتمي الدكتور هيغوي والدكتور فان باكيل إلى نقابة دولية من المؤرخين الفيروسيين. إنهم ينقبون عن تاريخ تفشي المرض عن طريق فحص الأدلة المتضمنة في المادة الوراثية للفيروسات المأخوذة من آلاف المرضى.

تغزو الفيروسات الخلية وتسيطر على أجهزتها الجزيئية ، مما يجعلها تنتج فيروسات جديدة.

العملية سريعة وقذرة. ونتيجة لذلك ، يمكن للفيروسات الجديدة اكتساب طفرة جديدة لم تكن موجودة في سلفها. إذا تمكن فيروس جديد من الهروب من مضيفه وإصابة أشخاص آخرين ، فسيرث ذريته تلك الطفرة.

يتطلب تتبع الطفرات الفيروسية تسلسل جميع المواد الوراثية في الفيروس – جينومه. بمجرد أن يجمع الباحثون الجينوم من عدد من عينات الفيروسات ، يمكنهم مقارنة طفراتهم.

يمكن بعد ذلك لبرامج الكمبيوتر المتطورة أن تكتشف كيف نشأت كل هذه الطفرات عندما تنحدر الفيروسات من سلف مشترك. إذا حصلوا على بيانات كافية ، يمكنهم إجراء تقديرات تقريبية حول المدة التي عاشها هؤلاء الأسلاف. وذلك لأن الطفرات تنشأ بوتيرة منتظمة تقريبًا ، مثل الساعة الجزيئية.

استخدم ماسيج بوني من جامعة ولاية بنسلفانيا وزملاؤه هذه الطريقة مؤخرًا لمعرفة من أين جاء الفيروس التاجي المسمى SARS-CoV-2 في المقام الأول. في حين أن نظريات المؤامرة قد تدّعي كذبًا أن الفيروس تم اختراعه في المختبر ، فإن جينوم الفيروس يوضح ذلك.

هناك العديد من أنواع الفيروسات التاجية التي تصيب الإنسان والحيوان. وجد الدكتور بوني وزملاؤه أن جينوم الفيروس الجديد يحتوي على عدد من الطفرات المشتركة مع سلالات الفيروسات التاجية التي تصيب الخفافيش.

ووجد الباحثون أن الفيروس التاجي الأكثر ارتباطا هو بمضرب حدوة حصان صيني. لكن الفيروس الجديد اكتسب بعض الطفرات الفريدة منذ انفصاله عن فيروس الخفافيش هذا منذ عقود.

قال الدكتور بوني أن فيروس الأسلاف ربما أدى إلى ظهور عدد من السلالات التي أصابت خفافيش حدوة الحصان ، وربما حيوانات أخرى في بعض الأحيان.

وقال “من المحتمل جدا أن هناك تنوعا كبيرا لا يستند إلى عينات”.

نسخ الأخطاء ليست الطريقة الوحيدة لظهور فيروسات جديدة. في بعض الأحيان يصيب نوعان من الفيروسات التاجية الخلية نفسها. تختلط موادهم الوراثية في فيروسات جديدة.

قال الدكتور بوني إنه من الممكن تمامًا ، في السنوات العشر أو العشرين الماضية ، نشأ فيروس هجين في بعض الخفافيش على شكل حدوة الحصان ، وهو مناسب تمامًا لإصابة البشر أيضًا. في وقت لاحق ، تمكن هذا الفيروس بطريقة أو بأخرى من عبور حاجز الأنواع.

وقال: “بين الحين والآخر ، يفوز أحد هذه الفيروسات باليانصيب”.

في يناير ، نشر فريق من الباحثين الصينيين والأستراليين الجينوم الأول للفيروس الجديد. منذ ذلك الحين ، قام باحثون من جميع أنحاء العالم بتسلسل أكثر من 3000 آخرين. بعضها متطابق وراثيًا مع بعضها البعض ، بينما يحمل البعض الآخر طفرات مميزة.

هذه مجرد عينة صغيرة من التنوع الكامل للفيروس. اعتبارًا من 8 أبريل ، كان هناك 1.5 مليون من Covid-19 ، وربما يكون الإجمالي الحقيقي ملايين أخرى. لكن بالفعل ، تكشف جينومات الفيروس عن الخطوط العريضة المخفية لتاريخه على مدى الأشهر القليلة الماضية.

مع ظهور الجينوم الجديد ، يقوم الباحثون بتحميله إلى قاعدة بيانات على الإنترنت تسمى. يقوم فريق من خبراء تطور الفيروسات بتحليل المجموعة المتزايدة من الجينومات في مشروع يسمى. هم باستمرار تحديث شجرة عائلة الفيروس.

تنتمي أعمق فروع الشجرة إلى سلالات من الصين. استخدم فريق Nextstrain أيضًا معدل الطفرة لتحديد أن الفيروس ربما انتقل لأول مرة إلى البشر من مضيف حيواني في أواخر عام 2019. في 31 ديسمبر ، أعلنت الصين أن الأطباء في ووهان يعالجون عشرات الحالات من مرض تنفسي جديد غامض.

في يناير ، مع اتضاح نطاق الكارثة في الصين ، بدأ عدد قليل من البلدان برنامج اختبار صارم. تمكنوا من تتبع وصول الفيروس على أراضيهم وتتبع انتشاره من خلال سكانها.

لكن الولايات المتحدة تخبطت في صنع أول مجموعات تشخيصية لها واقتصرت الاختبارات في البداية فقط على الأشخاص الذين قدموا من الصين وأظهروا أعراض Covid-19.

قال الدكتور هيغوي: “لقد كانت كارثة لم نختبرها”.

ظهرت بعض الحالات في نهاية يناير. ولكن كان من السهل رفضها باعتبارها واردات نادرة لم تؤدي إلى تفشي المرض المحلي.

وقد تحطم الوهم في نهاية فبراير من قبل تريفور بيدفورد ، الأستاذ المساعد في مركز فريد هاتشينسون لأبحاث السرطان وجامعة واشنطن وزملائه.

وباستخدام Nextstrain ، اكتشفوا أن فيروسًا تم التعرف عليه في مريض في أواخر فبراير كان لديه طفرة شاركها أحدهم تم تحديده في واشنطن في 20 يناير.

تشترك فيروسات واشنطن أيضًا في طفرات أخرى مشتركة مع تلك المعزولة في ووهان ، مما يشير إلى أن مسافرًا أحضر الفيروس التاجي من الصين.

مع هذا الاكتشاف ، أخذ الدكتور بيدفورد وزملاؤه زمام المبادرة في تسلسل جينومات فيروسات التاجية. أعطاهم تسلسل المزيد من الجينومات حول واشنطن رؤية أفضل لكيفية بدء تفشي المرض هناك.

وقال الدكتور بيدفورد “أنا واثق تمامًا من أنه لم ينتشر في ديسمبر في الولايات المتحدة”. “قد تكون هناك مقدمتان أخريان في يناير لم يتم إقلاعهما بنفس الطريقة.”

مع ظهور حالات جديدة في أجزاء أخرى من البلاد ، أنشأ باحثون آخرون خطوط أنابيب خاصة بهم. جاءت أول نتيجة إيجابية في نيويورك في 1 مارس ، وبعد أسبوعين ، ارتفع عدد المرضى إلى مستشفيات المدينة.

قال دكتور هيغوي: “فكرت ،” نحتاج إلى القيام بذلك من أجل نيويورك “.

وجدت الدكتورة هيغوي وزملاؤها بعض فيروسات نيويورك التي تشترك في طفرات فريدة لم يتم العثور عليها في مكان آخر. قالت: “حينها تعلم أن لديك انتقال صامت لفترة من الوقت”.

وقدر الدكتور هيغوي أن الفيروس بدأ في الانتشار في منطقة نيويورك قبل شهرين.

وبدأ الباحثون في جبل سيناء في ترتيب جينومات المرضى القادمين إلى المستشفى. ووجدوا أن أقرب الحالات التي تم تحديدها في نيويورك لم ترتبط بالحالات اللاحقة.

قالت آنا سيلفيا غونزاليس ريتش ، عضو فريق جبل سيناء ، “بعد أسبوعين ، بدأنا في رؤية فيروسات مرتبطة ببعضها البعض”.

ووجدت الدكتورة غونزاليس ريتش وزملاؤها أن هذه الفيروسات مطابقة عمليًا للفيروسات الموجودة في جميع أنحاء أوروبا. لا يمكنهم تحديد الرحلة التي وصل إليها فيروس معين في نيويورك. لكنهم يكتبون أن الفيروسات تكشف عن “فترة انتقال عالمي غير متتبع بين أواخر يناير ومنتصف فبراير”.

حتى الآن ، حدد باحثو جبل سيناء سبع سلالات منفصلة من الفيروسات التي دخلت نيويورك وبدأت في الانتشار. قال د. فان باكيل: “ربما سنجد المزيد”.

تكشف جينومات الفيروسات التاجية أيضًا عن تلميحات للسفر المبكر عبر البلاد.

اكتشف دكتور فان باكيل وزملاؤه فيروسًا واحدًا في نيويورك مطابقًا لأحد فيروسات واشنطن التي اكتشفها الدكتور بيدفورد وزملاؤه. في باحث في جامعة ييل وجد فيروس آخر متعلق بواشنطن. مجتمعة ، تشير الدراستان إلى أن الفيروس التاجي ينتقل من الساحل إلى الساحل لعدة أسابيع.

يحذر سيدني بيل ، عالم الأحياء الحسابي الذي يعمل مع فريق Nextstrain ، الناس من عدم قراءة الكثير في هذه الطفرات الجديدة بأنفسهم. قال الدكتور بيل: “فقط لأن شيئًا مختلفًا لا يعني أنه مهم”.

لا تحول الطفرات الفيروسات تلقائيًا إلى سلالات جديدة مخيفة. غالبًا ما لا تحدث أي تغيير على الإطلاق. قال الدكتور بيل: “بالنسبة لي ، الطفرات حتمية ومملة نوعًا ما”. “لكن في الأفلام ، تحصل على X-Men.”

يحب بيتر تيلين ، عالم الأحياء الجزيئية في مختبر الفيزياء التطبيقية بجامعة جونز هوبكنز ، التفكير في انتشار الفيروسات مثل هبوط بذور الهندباء في حقل فارغ.

تنمو الزهرة وتنتج بذور خاصة بها. انتشرت تلك البذور ونبتت. تنشأ طفرات جديدة عبر الأجيال حيث تملأ الهندباء الحقل. قال السيد تيلين: “لكنهم ما زالوا كلام الهندباء”.

في حين أن طفرات الفيروس التاجي مفيدة للتمييز بين السلالات ، إلا أنه ليس لها أي تأثير واضح على كيفية عمل الفيروس.

هذه أخبار جيدة للعلماء الذين يعملون على لقاح.

يأمل مطورو اللقاحات في محاربة Covid-19 من خلال تعليم أجسامنا صنع أجسام مضادة يمكنها الإمساك بالفيروس ومنع دخوله إلى الخلايا.

تتطور بعض الفيروسات بسرعة كبيرة لدرجة أنها تتطلب لقاحات يمكنها إنتاج العديد من الأجسام المضادة المختلفة. ليس هذا هو الحال مع Covid-19. ومثل الفيروسات التاجية الأخرى ، فإن معدل الطفرة البطيء نسبيًا مقارنة ببعض الفيروسات ، مثل الإنفلونزا.

على الرغم من صعوبة القتال ، تكشف طفراته أن الأمور يمكن أن تكون أسوأ بكثير.

بالطبع ، سيستمر الفيروس التاجي في التحور طالما أنه لا يزال يصيب الناس. من الممكن أن اللقاحات يجب أن تتغير لمواكبة الفيروس. ولهذا يحتاج العلماء إلى متابعة تتبع تاريخه.

[[[[ | اشترك في ]

[ad_2] المصدر: nytimes.com
الوسوم

مقالات ذات صلة

اترك تعليقاً

لن يتم نشر عنوان بريدك الإلكتروني. الحقول الإلزامية مشار إليها بـ *

زر الذهاب إلى الأعلى
إغلاق